过去硬盘主要接口由PIO4转变至DMA33时就曾经出现过不少的兼容性问题，如笔者的一块老式希捷2.5G只要接在支持DMA33的主板上就会频频出错，有时甚至连系统都无法正常安装！当硬盘接口升级至DMA66时又出现了同样的问题。由于当时DMA66硬盘早于支持它的主板面世，不少DMA66硬盘接在主板接口就会导致各种奇怪问题甚至有时无法正常启动，只有靠硬盘厂商推出的DMA66模式转DMA33模式方可正常工作，但降级使用总让不少用户耿耿于怀。
由于新式主板芯片的性能都不是很好，不少厂商都推出了在BX主板上集成DMA66控制器的新式主板，但由此导致的兼容性问题就更多了，如采用HiPoint芯片就比采用Promise芯片更容易出问题，而这些问题往往是蓝屏等严重错误。如今DMA100硬盘如IBM腾龙二代已经上市，815E芯片组也开始支持DMA100，大家可能又开始担心会不会又有新的兼容性问题出现。实际上这一次厂商早就注意了这个问题，IBM的腾龙二代硬盘可以自动识别接口类型，迈拓的钻石十代默认为DMA66模式需要时再通过软件切换至DMA100，再加上DMA100与DMA66连线相同，在主板上集成DMA100控制芯片的主板厂商也都选择了Promise的产品，所以DMA100引发的兼容性问题肯定要比从前少得多了。 | 
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